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靖國神社是中央的全國性神社，而在地方各府縣，另外有地方性的招魂社，已如前述。一九三〇年代，全國有招魂社百多間，一九三九年全部改稱作護國神社，成為靖國神社的地方分社， 這一靖國祭祀網絡，一直維持到今日，一九九一年，全國有護國神社五十二間，而戰殁軍人在原籍及首都均享有奉祀的禮遇。此外，在大戰期間，海外佔領區亦出現供奉靖國神靈—即陣亡將士—的神社， 香港的南海神社，可算是其中之一。

在靖國神社裏的靖國神靈，目前總數是二百四十六萬餘，早自吉田松陰和高杉晉作，晚至東條英機，皆在祭祀之列，除軍人外，亦包括因大戰而殉命的女護士、少女和女學生等女性五萬多人。 靖國神靈之中，除了一萬五千人是在幕末維新和西南戰爭的內戰中犧牲的軍士外，其餘的二百多萬均是在明治至昭和年間歷次對外戰爭中失掉生命的。

在戰場上陣亡的人的靈魂，經過招魂儀式後，便成為靖國神靈，不再是一般的亡靈；關於靖國神社的招魂儀式，村上重良在『國家神道』書中介紹説：「神社境內有舖滿細砂、圍以竹垣的聖域，稱為招魂齋庭， 合祀時，在這裏設置臨時殿堂，舉行招魂儀式；這種儀式照例在深夜凌晨二時許天未亮時舉行，是迎接自天而降的新神的靈魂，供奉在正殿的儀式。」在招魂齋庭的臨時殿堂裏， 設有一乘像轎一般的御羽車，車內供放著稱為靈璽簿的死難者名册，經過招魂儀式後，靈魂進入了靈璽簿，即成為靖國神靈，然後在燈火全無的深宵，在奏樂聲中，御羽車把靈璽簿載送到本殿供奉。 目前，靈璽簿是奉祀在靖國神社本殿後面的靈璽簿奉安殿裏的。

靖國神社自創建以來，得到明治、大正和昭和天皇的正式參拜（即親拜）共三十多次，其崇高地位可媲美伊勢神宮；一九四五年以前由陸軍省和海軍省管轄，戰後，國家神道制度遭廢除， 靖國神社也脫離與國家的關係，而以獨立的宗教法人的身分繼續存在；但不旋踵地自一九五〇年代開始，日本遺族會和自民黨等保守派組織，即不斷提出重新把靖國神社國營化的要求和國會法案， 自從一九七五年首相三木武夫參拜神社後，歷屆首相和內閣閣員多有參拜靖國神社的紀錄，可見靖國精神，仍舊是為人們所眷戀著的。

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